Doanh nghiệp FDI có được miễn thuế thu nhập doanh nghiệp trong 03 năm đầu không?

Trong quá trình triển khai chính sách hỗ trợ doanh nghiệp nhỏ và vừa theo Nghị quyết số 198/2025/QH15, nhiều doanh nghiệp có vốn đầu tư nước ngoài (FDI) băn khoăn liệu mình có thuộc đối tượng được miễn thuế thu nhập doanh nghiệp (TNDN) trong 03 năm đầu thành lập hay không.

Thực tế cho thấy, trong thời gian qua đã xuất hiện một số cách hiểu khác nhau giữa các cơ quan quản lý về việc áp dụng chính sách ưu đãi này đối với doanh nghiệp FDI. Tuy nhiên, cơ quan thuế trung ương đã có văn bản hướng dẫn chính thức làm rõ nội dung trên. Đây là cơ sở quan trọng để các doanh nghiệp FDI đánh giá khả năng được hưởng ưu đãi thuế và chủ động xây dựng phương án đầu tư phù hợp. Bài viết dưới đây sẽ làm rõ quy định và điều kiện để được miễn thuế TNDN trong 03 năm đầu.

I. Cơ sở pháp lý

- Luật Thuế thu nhập doanh nghiệp hiện hành và các văn bản hướng dẫn thi hành.

- Luật Hỗ trợ doanh nghiệp nhỏ và vừa năm 2017.

- Nghị quyết số 198/2025/QH15 của Quốc hội về một số cơ chế, chính sách đặc biệt phát triển kinh tế tư nhân.

- Nghị định số 20/2026/NĐ-CP của Chính phủ quy định chi tiết và hướng dẫn thi hành một số điều của Nghị quyết số 198/2025/QH15.

- Nghị định số 80/2021/NĐ-CP quy định chi tiết một số điều của Luật Hỗ trợ doanh nghiệp nhỏ và vừa.

- Công văn số 3896/CT-CS ngày 11/6/2026 của Cục Thuế về việc hướng dẫn thực hiện chính sách miễn thuế thu nhập doanh nghiệp đối với doanh nghiệp nhỏ và vừa.

II. Nội dung tư vấn

1. Quy định về đối tượng được áp dụng Nghị quyết 198/2025/QH15

Trước khi xem xét doanh nghiệp FDI có được miễn thuế TNDN hay không, cần xác định phạm vi điều chỉnh và đối tượng áp dụng của Nghị quyết số 198/2025/QH15.

Điều 1 Nghị quyết số 198/2025/QH15 quy định:

"Nghị quyết này quy định một số cơ chế, chính sách đặc biệt phát triển kinh tế tư nhân".

Đồng thời, Điều 2 Nghị quyết số 198/2025/QH15 quy định:

"Nghị quyết này áp dụng đối với doanh nghiệp, hộ kinh doanh, cá nhân kinh doanh và tổ chức, cá nhân khác có liên quan".

Có thể thấy, quy định về đối tượng áp dụng chỉ sử dụng khái niệm "doanh nghiệp" mà không có nội dung nào loại trừ doanh nghiệp có vốn đầu tư nước ngoài khỏi phạm vi điều chỉnh của Nghị quyết.

Đây là cơ sở pháp lý đầu tiên cho thấy việc doanh nghiệp FDI không đương nhiên bị loại khỏi các chính sách hỗ trợ được quy định tại Nghị quyết số 198/2025/QH15.

2. Chính sách miễn thuế TNDN 03 năm đầu đối với doanh nghiệp nhỏ và vừa

Khoản 4 Điều 10 Nghị quyết số 198/2025/QH15 quy định:

"Miễn thuế thu nhập doanh nghiệp cho doanh nghiệp nhỏ và vừa trong 03 năm kể từ ngày được cấp Giấy chứng nhận đăng ký doanh nghiệp lần đầu".

Từ quy định trên có thể rút ra ba điều kiện cơ bản:

• Chủ thể được hưởng ưu đãi là doanh nghiệp nhỏ và vừa;
• Doanh nghiệp phải được cấp Giấy chứng nhận đăng ký doanh nghiệp lần đầu;
• Thời gian miễn thuế là 03 năm kể từ thời điểm được cấp Giấy chứng nhận đăng ký doanh nghiệp.

Đáng lưu ý, quy định này cũng không đặt ra điều kiện doanh nghiệp phải là doanh nghiệp trong nước hoặc doanh nghiệp có 100% vốn Việt Nam.

3. Vướng mắc trong quá trình áp dụng đối với doanh nghiệp FDI

Sau khi Nghị quyết số 198/2025/QH15 được ban hành, một số doanh nghiệp FDI phát sinh băn khoăn về việc liệu chính sách hỗ trợ phát triển kinh tế tư nhân có áp dụng cho doanh nghiệp có vốn đầu tư nước ngoài hay không.

Nguyên nhân xuất phát từ cách hiểu rằng chính sách phát triển kinh tế tư nhân chủ yếu hướng đến doanh nghiệp trong nước. Từ đó dẫn đến việc một số doanh nghiệp FDI chưa mạnh dạn áp dụng chính sách miễn thuế TNDN trong giai đoạn đầu hoạt động.

Thực tế này đặt ra yêu cầu cần có hướng dẫn thống nhất từ cơ quan quản lý thuế ở cấp trung ương.

4. Quan điểm chính thức của Cục Thuế: Doanh nghiệp FDI vẫn được miễn thuế TNDN 03 năm

Ngày 11/6/2026, Cục Thuế ban hành Công văn số 3896/CT-CS hướng dẫn về việc áp dụng chính sách miễn thuế TNDN đối với doanh nghiệp có vốn đầu tư nước ngoài.

Theo hướng dẫn của Cục Thuế:

Trường hợp doanh nghiệp có vốn đầu tư nước ngoài được thành lập, đăng ký hoạt động theo quy định của pháp luật Việt Nam, được cấp Giấy chứng nhận đăng ký doanh nghiệp lần đầu, đáp ứng tiêu chí xác định doanh nghiệp nhỏ và vừa theo quy định của Luật Hỗ trợ doanh nghiệp nhỏ và vừa và Nghị định số 80/2021/NĐ-CP, đồng thời không thuộc các trường hợp không được áp dụng ưu đãi thì được miễn thuế thu nhập doanh nghiệp trong 03 năm kể từ ngày được cấp Giấy chứng nhận đăng ký doanh nghiệp lần đầu.

Như vậy, Cục Thuế đã chính thức khẳng định yếu tố vốn đầu tư nước ngoài không phải là căn cứ để loại trừ quyền hưởng ưu đãi thuế.

5. Doanh nghiệp FDI cần đáp ứng những điều kiện gì?

Từ Nghị quyết số 198/2025/QH15, Nghị định số 20/2026/NĐ-CP và Công văn số 3896/CT-CS có thể xác định doanh nghiệp FDI phải đáp ứng đồng thời các điều kiện sau:

Thứ nhất, được thành lập và hoạt động theo pháp luật Việt Nam

Doanh nghiệp phải được cơ quan có thẩm quyền cấp Giấy chứng nhận đăng ký doanh nghiệp và hoạt động hợp pháp tại Việt Nam.

Thứ hai, đáp ứng tiêu chí doanh nghiệp nhỏ và vừa

Việc xác định doanh nghiệp nhỏ và vừa được thực hiện theo Luật Hỗ trợ doanh nghiệp nhỏ và vừa và Nghị định số 80/2021/NĐ-CP.

 Thứ ba, được cấp Giấy chứng nhận đăng ký doanh nghiệp lần đầu

Đây là điều kiện bắt buộc được quy định trực tiếp tại khoản 4 Điều 10 Nghị quyết số 198/2025/QH15.

Thứ tư, không thuộc trường hợp bị loại trừ

Doanh nghiệp cần rà soát các trường hợp không được áp dụng ưu đãi theo quy định tại Nghị định số 20/2026/NĐ-CP, đặc biệt là các trường hợp được thành lập trên cơ sở chia, tách, hợp nhất, sáp nhập hoặc tái cấu trúc nhằm hưởng ưu đãi thuế.

Quy định miễn thuế TNDN cho doanh nghiệp nhỏ và vừa trong 3 năm đầu thành lập không áp dụng đối với:

- Doanh nghiệp thành lập mới do sáp nhập, hợp nhất, chia, tách, chuyển đổi chủ sở hữu, chuyển đổi loại hình doanh nghiệp.

- Doanh nghiệp thành lập mới mà người đại diện theo pháp luật (trừ trường hợp người đại diện theo pháp luật không phải là thành viên góp vốn), thành viên hợp danh hoặc người có số vốn góp cao nhất đã tham gia hoạt động kinh doanh với vai trò là người đại diện theo pháp luật, thành viên hợp danh hoặc người có số vốn góp cao nhất trong các doanh nghiệp đang hoạt động hoặc đã giải thể nhưng chưa được 12 tháng tính từ thời điểm giải thể doanh nghiệp cũ đến thời điểm thành lập doanh nghiệp mới.

- Không áp dụng đối với các thu nhập quy định tại khoản 3 Điều 18 Luật Thuế thu nhập doanh nghiệp 2025

6. Một số lưu ý pháp lý đối với nhà đầu tư nước ngoài

Từ hướng dẫn mới của Cục Thuế, nhà đầu tư nước ngoài cần lưu ý:

• Không phải mọi doanh nghiệp FDI đều được miễn thuế TNDN 03 năm đầu;
• Điều kiện quyết định là quy mô doanh nghiệp và điều kiện thành lập, không phải tỷ lệ sở hữu vốn nước ngoài;
• Doanh nghiệp nên đánh giá điều kiện hưởng ưu đãi ngay từ giai đoạn chuẩn bị hồ sơ đầu tư;
• Hồ sơ chứng minh doanh nghiệp nhỏ và vừa cần được lưu giữ đầy đủ để phục vụ công tác thanh tra, kiểm tra thuế sau này;
• Trường hợp có tình huống đặc thù nên chủ động xin ý kiến cơ quan thuế quản lý trực tiếp bằng văn bản

Bài viết tham khảo: Điều kiện để được hưởng miễn thuế TNDN trong 3 năm cho doanh nghiệp nhỏvà vừa

UY TÍN – CHẤT LƯỢNG – HIỆU QUẢ CAO là những giá trị chúng tôi mang tới cho Quý khách hàng. Đáp lại những giá trị đó là những phản hồi tích cực đã mang lại động lực cho Khánh An phát triển như ngày hôm nay.

Trên đây là nội dung tư vấn của chúng tôi. Mọi thắc mắc, Quý khách hàng vui lòng liên hệ trực tiếp với CÔNG TY LUẬT TNHH KHÁNH AN BUSINESS LAW chúng tôi để được tư vấn chi tiết và hỗ trợ thực hiện một cách nhanh gọn, hiệu quả.

Thông tin liên hệ:

CÔNG TY LUẬT TNHH KHÁNH AN BUSINESS LAW

Mobile: 02466885821 / 097.652.9499

Địa chỉ: Toà nhà 88 Tô Vĩnh Diện, phường Khương Đình, Hà Nội.

Web: khanhanlaw.com

Email: Info@khanhanlaw.net

Rất hân hạnh được hợp tác cùng Quý khách!